川大学华西医院感染性疾病中心始于1937年华西协和大学医学院附属医院内科的传染病室，于1953年正式建科，是国家首批建立博士点、硕士点和博士后流动站的学科，国家临床重点专科，国家药品临床研究机构抗感染专业基地，国家卫健委感染病专业住院医师培训基地，国家感染性疾病临床医学研究中心分中心，国家卫健委医院管理研究“细菌真菌感染诊治培训项目（培元计划）”基地，四川省感染性疾病诊疗质量控制中心，四川省专科医师规范化培训基地。
   感染性疾病中心拥有教育部长江学者、国家杰出青年基金获得者、国家优秀青年基金获得者，国务院政府特殊津贴获得者，以及卫生部批准的有突出贡献的中青年专家等高层次人才。中心现有专业技术人员136人，正高职称15人，副高职称18人，博士生导师5人，硕士生导师15人。拥有病床130张，设有传染病房（主要收治病毒性肝炎、HIV感染等法定传染病）、感染病房（主要收治发热待诊、各类细菌/真菌/寄生虫感染[如免疫受限患者感染、术后感染、隐球菌脑膜炎、肝脓肿等]）、感染ICU、肝炎/肝病/感染门诊、艾滋病门诊、肠道门诊等诊疗病区和人工肝治疗中心以及感染性疾病研究室。
   中心具有多个各具特色的亚专业，包括病毒性肝炎及肝病、肝衰竭与人工肝、发热待诊、细菌/真菌感染、艾滋病和结核病等。学科发挥感染疾病诊治领域的中心指导作用，在感染的病原学诊断、重症肝病诊治、各类突发传染病的现场抢救及工作指导、发热待诊、各类耐药菌感染、导管相关性感染、免疫功能低下者感染、肺外结核病、寄生虫感染、医院感染防控，艾滋病抗病毒治疗以及机会性感染等方面具有丰富的经验，向整个西南地区提供了重要的技术支撑，发挥着重要的咨询及指导作用。作为西南地区重症肝病治疗中心和人工肝治疗中心，具有各种重症肝炎抢救治疗的条件和技术，近年来开展了多项人工肝优化治疗，开展了包括血浆置换、MARS、血液滤过、血液灌流、胆红素吸附血浆灌流、双重吸附联合血浆置换等所有人工肝治疗模式，年完成人工肝超过1700例次，位居全国前列。中心还开展了噬菌体治疗疑难耐药菌感染、干细胞治疗肝衰竭等技术。
  近年来针对疑难复杂感染，引进并开展了隐球菌荚膜多糖抗原检测、布病抗体检测、呼吸道十三种病原体核酸检测、宏基因组二代测序、三代测序等检测技术，极大提高了各类耐药菌感染、导管相关性感染、免疫功能低下者感染、及院内感染控制及机会性感染的诊断水平，并根据检测结果对疑难复杂感染实施精准抗感染药物应用。病原微生物团队通过宏基因组测序等新技术，在临床工作中还发现了新菌种多种，并以发现地华西和川大命名为华西克雷伯菌、华西肠杆菌、华西普罗威登斯菌、华西假单胞菌、川大肠杆菌等。积极开展耐药菌感染诊治研究，从耐药菌的致病性、耐药机制、传播机制、早期病原学诊断、个体化治疗、精准防控、噬菌体治疗等多方面进行了深入研究。
   经过多年不断建设，感染性疾病中心目前已成为我国西部地区感染性疾病疑难重症的诊治中心，感染性疾病临床科学研究和专业人才培养的重要基地。